Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC10A2Q12908 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms