Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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