Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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KCNMA1Q12791 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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KCNMA1Q12791 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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KCNMA1Q12791 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMA1Q12791 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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