Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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