Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms