Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK1Q08629 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK1Q08629 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms