Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms