Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms