Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms