Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms