Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms