Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARID5AQ03989 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms