Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms