Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A3Q01955 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A3Q01955 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms