Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms