Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB1P82279 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB1P82279 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB1P82279 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms