Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRX1P78414 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRX1P78414 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRX1P78414 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRX1P78414 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms