Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX1P78337 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX1P78337 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX1P78337 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITX1P78337 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX1P78337 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms