Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NOMO3P69849 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOMO3P69849 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms