Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF6P62330 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms