Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MFAP4P55083 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms