Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAPAP54920 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAPAP54920 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAPAP54920 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms