Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms