Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC3P51654 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC3P51654 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms