Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT4P50991 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT4P50991 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT4P50991 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT4P50991 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT4P50991 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms