Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP153P49790 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP153P49790 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP153P49790 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP153P49790 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms