Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLK1P49759 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms