Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTAP49354 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms