Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms