Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms