Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms