Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SFNP31947 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SFNP31947 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFNP31947 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFNP31947 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFNP31947 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFNP31947 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFNP31947 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms