Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms