Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD34P28906 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD34P28906 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD34P28906 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD34P28906 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms