Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms