Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms