Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms