Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms