Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms