Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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