Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms