Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms