Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD247P20963 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD247P20963 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD247P20963 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD247P20963 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD247P20963 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms