Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASTP20810 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASTP20810 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASTP20810 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASTP20810 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASTP20810 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASTP20810 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms