Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5AP20339 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5AP20339 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms