Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCLP19338 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCLP19338 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCLP19338 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCLP19338 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.7 ms