Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTPS1P17812 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms