Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms