Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms