Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA1P17302 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA1P17302 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA1P17302 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA1P17302 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA1P17302 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms